Em primeiro lugar, de substituição ou ignorar só serão aplicadas aos novos URLs gerados. (É necessário evitar páginas 404 em URLs antigas que possam prejudicar o SEO).
Você terá que atualizar os URLs diretamente no painel Linguise e criar suas regras de redirecionamento em seu arquivo .htaccess.
Agora, sobre as regras não aplicadas no conteúdo html, pode ser por causa do cache local .
Você pode limpar o cache local nas configurações de extensão no lado administrativo do seu site. Basta pressionar o botão “Limpar cache” e deve estar bom. Se você tiver outros serviços de cache na frente do seu site, como Cloudflare, talvez seja necessário limpá-lo também.