¿Cómo quitar el borde de la caja de la bandera?

Puedes copiar esta regla CSS en tu archivo CSS personalizado o en la configuración avanzada del plugin Linguise , dentro de los campos CSS personalizados:

				
					/* remove background color */
.linguise_switcher{
    background-color: transparent !important;
}

/* remove border */
#dropdown .linguise_switcher_dropdown li{
    border-bottom: none !important;
}

#dropdown .linguise_switcher_dropdown li.linguise_current .linguise_current_lang{
    border: none !important;
}